ДПАУ затвердила Методичні рекомендації з перевірки податкової звітності з ПДВ (лист від 22.10.2009 р. № 23235/7/16-1116). Передбачається, що перевірка податкових декларацій має відбуватись в три етапи:

- до приймання звітності – вивчення наявної в органах ДПС історії платника податку та інформації з інших джерел (АРМ «Митниця», Загального реєстру податкових накладних, Системи співставлення податкових зобов’язань та податкового кредиту контагентів;

- під час приймання звітності – безпосереднє проведення документальної невиїзної (камеральної) перевірки. При цьому ДПАУ рекомендує податківцям досліджувати податкові ризики, за сукупністю яких платники відносяться до однієї з трьох груп. Перелік таких ризиків наведено у додатку 1 до Рекомендацій;

- після приймання звітності – формування обгрунтованих висновків та відповідна передача їх до підрозділів податкового контролю юридичних осіб та податкової міліції із застосуванням системи подвійного контролю.

За результатами аналізу одержаної звітності платників ПДВ вирішено поділити на категорії:

-         сумлінні платники;

-         платники реального сектору економіки, які мінімізують податкові зобов’язання  шляхом використання послуг платників з ознаками шахрайства. До таких платників ДПАУ відносить тих суб’єктів, які здійснюють господарську діяльність, мають основні виробничі фонди, достатню кількість трудових ресурсів для здійснення такої діяльності, однак використовують схеми ухилення від оподаткування (в ланцюгах постачання та придбання товарів використовують «транзитерів», вигодоформуючих платників), мають податкове навантаження нижче середнього по галузі, тобто «потенційно мають резерви для збільшення надходжень до бюджету)»;

-         платники з ознаками шахрайства. Йдеться про суб’єктів господарювання, які не мають основних виробничих фондів, мають недостатню кількість трудових ресурсів для здійснення такої діяльності та використовують для ухиляння від оподаткування так звані «податкові ями» (не декларують та не сплачують податкові зобов’язання або декларують не в повному обсязі), «транзитерів», які використовуються для передачі податкового кредиту, сформованого «податковою ямою», до ризикових платників податків ПДВ – мінімізаторів.

Окрім того ДПАУ затвердила три Порядки  опрацювання звітності цих категорій платників податків ПДВ.